Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PROB1E7EW31 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PROB1E7EW31 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PROB1E7EW31 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PROB1E7EW31 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PROB1E7EW31 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PROB1E7EW31 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PROB1E7EW31 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PROB1E7EW31 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PROB1E7EW31 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PROB1E7EW31 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PROB1E7EW31 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PROB1E7EW31 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROB1E7EW31 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROB1E7EW31 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROB1E7EW31 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROB1E7EW31 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PROB1E7EW31 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROB1E7EW31 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROB1E7EW31 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROB1E7EW31 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PROB1E7EW31 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PROB1E7EW31 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PROB1E7EW31 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PROB1E7EW31 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PROB1E7EW31 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PROB1E7EW31 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PROB1E7EW31 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PROB1E7EW31 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PROB1E7EW31 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROB1E7EW31 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PROB1E7EW31 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PROB1E7EW31 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PROB1E7EW31 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PROB1E7EW31 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PROB1E7EW31 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PROB1E7EW31 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PROB1E7EW31 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PROB1E7EW31 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PROB1E7EW31 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PROB1E7EW31 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PROB1E7EW31 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PROB1E7EW31 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PROB1E7EW31 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PROB1E7EW31 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PROB1E7EW31 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PROB1E7EW31 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PROB1E7EW31 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PROB1E7EW31 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PROB1E7EW31 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PROB1E7EW31 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PROB1E7EW31 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PROB1E7EW31 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PROB1E7EW31 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PROB1E7EW31 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PROB1E7EW31 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PROB1E7EW31 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PROB1E7EW31 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PROB1E7EW31 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PROB1E7EW31 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PROB1E7EW31 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PROB1E7EW31 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PROB1E7EW31 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PROB1E7EW31 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PROB1E7EW31 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PROB1E7EW31 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PROB1E7EW31 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PROB1E7EW31 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PROB1E7EW31 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PROB1E7EW31 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PROB1E7EW31 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PROB1E7EW31 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PROB1E7EW31 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PROB1E7EW31 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PROB1E7EW31 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PROB1E7EW31 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PROB1E7EW31 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PROB1E7EW31 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PROB1E7EW31 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PROB1E7EW31 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PROB1E7EW31 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PROB1E7EW31 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PROB1E7EW31 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PROB1E7EW31 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PROB1E7EW31 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms