Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGLL3A8MV65 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VGLL3A8MV65 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGLL3A8MV65 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGLL3A8MV65 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGLL3A8MV65 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VGLL3A8MV65 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VGLL3A8MV65 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGLL3A8MV65 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGLL3A8MV65 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGLL3A8MV65 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGLL3A8MV65 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGLL3A8MV65 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGLL3A8MV65 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VGLL3A8MV65 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGLL3A8MV65 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGLL3A8MV65 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGLL3A8MV65 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGLL3A8MV65 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGLL3A8MV65 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGLL3A8MV65 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VGLL3A8MV65 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VGLL3A8MV65 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VGLL3A8MV65 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VGLL3A8MV65 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VGLL3A8MV65 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VGLL3A8MV65 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VGLL3A8MV65 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VGLL3A8MV65 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VGLL3A8MV65 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VGLL3A8MV65 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VGLL3A8MV65 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VGLL3A8MV65 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VGLL3A8MV65 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGLL3A8MV65 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGLL3A8MV65 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGLL3A8MV65 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGLL3A8MV65 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGLL3A8MV65 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGLL3A8MV65 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGLL3A8MV65 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VGLL3A8MV65 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VGLL3A8MV65 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VGLL3A8MV65 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VGLL3A8MV65 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VGLL3A8MV65 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VGLL3A8MV65 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VGLL3A8MV65 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VGLL3A8MV65 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGLL3A8MV65 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGLL3A8MV65 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VGLL3A8MV65 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGLL3A8MV65 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGLL3A8MV65 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGLL3A8MV65 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGLL3A8MV65 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGLL3A8MV65 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VGLL3A8MV65 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGLL3A8MV65 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGLL3A8MV65 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGLL3A8MV65 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGLL3A8MV65 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGLL3A8MV65 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGLL3A8MV65 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGLL3A8MV65 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms