Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYSRT1A8MQ03 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYSRT1A8MQ03 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYSRT1A8MQ03 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYSRT1A8MQ03 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYSRT1A8MQ03 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYSRT1A8MQ03 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYSRT1A8MQ03 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYSRT1A8MQ03 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYSRT1A8MQ03 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYSRT1A8MQ03 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYSRT1A8MQ03 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYSRT1A8MQ03 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYSRT1A8MQ03 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYSRT1A8MQ03 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CYSRT1A8MQ03 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CYSRT1A8MQ03 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYSRT1A8MQ03 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYSRT1A8MQ03 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYSRT1A8MQ03 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYSRT1A8MQ03 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYSRT1A8MQ03 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYSRT1A8MQ03 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYSRT1A8MQ03 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYSRT1A8MQ03 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYSRT1A8MQ03 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYSRT1A8MQ03 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYSRT1A8MQ03 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYSRT1A8MQ03 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYSRT1A8MQ03 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYSRT1A8MQ03 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CYSRT1A8MQ03 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYSRT1A8MQ03 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYSRT1A8MQ03 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYSRT1A8MQ03 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CYSRT1A8MQ03 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYSRT1A8MQ03 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYSRT1A8MQ03 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYSRT1A8MQ03 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYSRT1A8MQ03 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYSRT1A8MQ03 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYSRT1A8MQ03 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYSRT1A8MQ03 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYSRT1A8MQ03 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYSRT1A8MQ03 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYSRT1A8MQ03 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYSRT1A8MQ03 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CYSRT1A8MQ03 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYSRT1A8MQ03 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYSRT1A8MQ03 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYSRT1A8MQ03 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYSRT1A8MQ03 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYSRT1A8MQ03 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms