Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBX1A6NMT0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBX1A6NMT0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBX1A6NMT0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBX1A6NMT0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBX1A6NMT0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBX1A6NMT0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBX1A6NMT0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBX1A6NMT0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBX1A6NMT0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBX1A6NMT0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBX1A6NMT0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBX1A6NMT0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBX1A6NMT0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBX1A6NMT0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBX1A6NMT0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DBX1A6NMT0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBX1A6NMT0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBX1A6NMT0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBX1A6NMT0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBX1A6NMT0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBX1A6NMT0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBX1A6NMT0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBX1A6NMT0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBX1A6NMT0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBX1A6NMT0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBX1A6NMT0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBX1A6NMT0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DBX1A6NMT0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DBX1A6NMT0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DBX1A6NMT0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DBX1A6NMT0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DBX1A6NMT0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DBX1A6NMT0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DBX1A6NMT0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DBX1A6NMT0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DBX1A6NMT0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBX1A6NMT0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBX1A6NMT0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBX1A6NMT0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBX1A6NMT0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBX1A6NMT0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBX1A6NMT0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBX1A6NMT0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBX1A6NMT0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBX1A6NMT0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBX1A6NMT0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBX1A6NMT0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DBX1A6NMT0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBX1A6NMT0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DBX1A6NMT0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DBX1A6NMT0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DBX1A6NMT0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DBX1A6NMT0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DBX1A6NMT0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DBX1A6NMT0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DBX1A6NMT0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DBX1A6NMT0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms