Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00862A6NCI5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00862A6NCI5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00862A6NCI5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00862A6NCI5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00862A6NCI5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00862A6NCI5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00862A6NCI5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00862A6NCI5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00862A6NCI5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00862A6NCI5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00862A6NCI5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00862A6NCI5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00862A6NCI5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00862A6NCI5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00862A6NCI5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00862A6NCI5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00862A6NCI5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00862A6NCI5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00862A6NCI5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00862A6NCI5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00862A6NCI5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00862A6NCI5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00862A6NCI5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00862A6NCI5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINC00862A6NCI5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00862A6NCI5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00862A6NCI5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00862A6NCI5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00862A6NCI5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00862A6NCI5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00862A6NCI5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00862A6NCI5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00862A6NCI5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00862A6NCI5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00862A6NCI5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00862A6NCI5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00862A6NCI5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00862A6NCI5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00862A6NCI5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00862A6NCI5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00862A6NCI5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00862A6NCI5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00862A6NCI5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00862A6NCI5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00862A6NCI5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00862A6NCI5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00862A6NCI5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00862A6NCI5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00862A6NCI5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00862A6NCI5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00862A6NCI5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00862A6NCI5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00862A6NCI5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LINC00862A6NCI5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00862A6NCI5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00862A6NCI5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00862A6NCI5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00862A6NCI5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00862A6NCI5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00862A6NCI5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00862A6NCI5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00862A6NCI5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00862A6NCI5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00862A6NCI5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00862A6NCI5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00862A6NCI5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00862A6NCI5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00862A6NCI5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms