Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB19A4D1S5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB19A4D1S5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB19A4D1S5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB19A4D1S5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB19A4D1S5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB19A4D1S5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB19A4D1S5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB19A4D1S5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB19A4D1S5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB19A4D1S5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB19A4D1S5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB19A4D1S5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB19A4D1S5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB19A4D1S5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB19A4D1S5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB19A4D1S5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB19A4D1S5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB19A4D1S5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB19A4D1S5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB19A4D1S5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB19A4D1S5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB19A4D1S5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB19A4D1S5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB19A4D1S5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB19A4D1S5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB19A4D1S5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB19A4D1S5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB19A4D1S5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB19A4D1S5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB19A4D1S5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB19A4D1S5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB19A4D1S5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB19A4D1S5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB19A4D1S5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB19A4D1S5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB19A4D1S5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB19A4D1S5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB19A4D1S5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB19A4D1S5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB19A4D1S5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB19A4D1S5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB19A4D1S5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB19A4D1S5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB19A4D1S5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB19A4D1S5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB19A4D1S5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB19A4D1S5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB19A4D1S5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB19A4D1S5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB19A4D1S5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB19A4D1S5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB19A4D1S5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB19A4D1S5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB19A4D1S5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB19A4D1S5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB19A4D1S5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB19A4D1S5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB19A4D1S5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB19A4D1S5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB19A4D1S5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB19A4D1S5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB19A4D1S5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB19A4D1S5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB19A4D1S5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB19A4D1S5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms