Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4D1N5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4D1N5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4D1N5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A4D1N5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4D1N5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A4D1N5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4D1N5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A4D1N5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4D1N5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4D1N5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4D1N5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4D1N5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A4D1N5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4D1N5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4D1N5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4D1N5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4D1N5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4D1N5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4D1N5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4D1N5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4D1N5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4D1N5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
A4D1N5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4D1N5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4D1N5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4D1N5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4D1N5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4D1N5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4D1N5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4D1N5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4D1N5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4D1N5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4D1N5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4D1N5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A4D1N5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
A4D1N5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A4D1N5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4D1N5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4D1N5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4D1N5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4D1N5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A4D1N5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A4D1N5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A4D1N5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A4D1N5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4D1N5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4D1N5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4D1N5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4D1N5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4D1N5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4D1N5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4D1N5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4D1N5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4D1N5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4D1N5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4D1N5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4D1N5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4D1N5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4D1N5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4D1N5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4D1N5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4D1N5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4D1N5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4D1N5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4D1N5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4D1N5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4D1N5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4D1N5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4D1N5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4D1N5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
A4D1N5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A4D1N5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A4D1N5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A4D1N5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A4D1N5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A4D1N5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A4D1N5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A4D1N5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A4D1N5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4D1N5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4D1N5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4D1N5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4D1N5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4D1N5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4D1N5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4D1N5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4D1N5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4D1N5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4D1N5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4D1N5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4D1N5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4D1N5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4D1N5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4D1N5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4D1N5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4D1N5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A4D1N5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A4D1N5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A4D1N5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms