Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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