Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXY3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXY3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0J9YXY3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0J9YXY3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0J9YXY3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0J9YXY3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0J9YXY3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0J9YXY3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
A0A0J9YXY3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A0A0J9YXY3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0J9YXY3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A0A0J9YXY3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
A0A0J9YXY3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms