Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms