Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 CLDND1-223ENST00000511081 642 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AL139022.1-202ENST00000553633 796 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC084064.1-201ENST00000569938 419 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 RN7SL811P-201ENST00000580735 298 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC007728.3-201ENST00000602304 746 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AP002986.1-203ENST00000602310 330 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC008897.3-201ENST00000607296 483 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 DAP3-225ENST00000535183 1894 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 MAEL-206ENST00000622874 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 CHTF8P1-201ENST00000414660 1541 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ZNF772-209ENST00000615214 1506 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 HEXA-209ENST00000567159 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 SUCLG2-AS1-202ENST00000482677 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 DRC1-201ENST00000288710 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 PRICKLE1-215ENST00000640055 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 KATNAL2-202ENST00000356157 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 PTPRR-209ENST00000549308 1603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 TPX2-201ENST00000300403 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 OR2B11-201ENST00000318749 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 GNAS-209ENST00000371081 730 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 SMIM21-201ENST00000382638 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 MRPS11P1-201ENST00000437558 522 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 GPAT2P2-201ENST00000445404 863 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 RN7SL454P-201ENST00000492744 243 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 HNRNPA3P13-201ENST00000512222 1122 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 MIOXP1-201ENST00000521205 835 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC009646.2-202ENST00000524425 826 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 MAX-216ENST00000556979 615 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ENO1P2-201ENST00000557166 974 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 IGHV1OR16-2-201ENST00000564937 349 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC140658.2-201ENST00000566360 348 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 SH3GL1P2-201ENST00000582245 1082 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 LINC00663-207ENST00000590092 1023 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 TPRXL-213ENST00000636198 651 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 CA3-201ENST00000285381 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ZSWIM5P2-201ENST00000420212 2038 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ZBTB20-212ENST00000474710 2757 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 XPNPEP1-203ENST00000369683 2344 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 NTM-221ENST00000539799 2550 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 FAM47B-201ENST00000329357 2120 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 LDAH-204ENST00000403006 1895 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 PRAMEF27-201ENST00000436041 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AC007277.1-201ENST00000428156 2189 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AL109618.1-201ENST00000434910 1683 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 SLC22A12-204ENST00000377574 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 RASGRP4-208ENST00000587753 3011 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ZP1-201ENST00000278853 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 POC5-213ENST00000514838 1984 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AL645944.2-201ENST00000641702 1953 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 AL354674.1-201ENST00000585222 1780 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 CYP3A4-202ENST00000354593 2342 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 STAT6-204ENST00000538913 2879 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPRJQ12913 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms