Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RN7SKP90-201ENST00000363013 335 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 DOCK2-201ENST00000256935 6097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CAMK2B-201ENST00000258682 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SCNN1B-201ENST00000307331 2085 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 FERMT2-205ENST00000553373 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 BCL2L13-207ENST00000418951 5062 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SRP72-201ENST00000342756 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 FCGR3A-206ENST00000443193 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PIK3CG-202ENST00000440650 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 HDAC9-228ENST00000524023 2199 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CCDC170-201ENST00000239374 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TMEM255A-201ENST00000309720 3394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ARHGEF39-201ENST00000378387 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ADD1-210ENST00000503455 3206 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CAMSAP2-202ENST00000358823 7352 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TCN2-203ENST00000407817 1870 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LINC01163-202ENST00000630252 3086 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 DDR1-239ENST00000452441 3857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC126603.1-201ENST00000557586 2512 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 FNDC9-201ENST00000312349 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PILRA-201ENST00000198536 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TMPRSS7-205ENST00000617607 2377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 HHAT-206ENST00000537898 3446 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CSPG4P10-202ENST00000612093 3411 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 MARCH8-202ENST00000395769 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ZMIZ2-201ENST00000265346 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AL158801.2-201ENST00000554650 554 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SLC6A3-201ENST00000270349 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RPL23AP87-201ENST00000425566 2256 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ADAM32-203ENST00000437682 2281 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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