Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 Z95115.1-201ENST00000566814 2032 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 FP565260.3-202ENST00000623960 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LTF-201ENST00000231751 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 RASGRP4-208ENST00000587753 3011 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC005072.1-201ENST00000606640 1779 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 TCF7L2-223ENST00000629706 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SPIN2A-202ENST00000374908 2468 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 MS4A15-202ENST00000405633 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ZSCAN2-204ENST00000358472 3231 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AL606970.1-201ENST00000445442 2559 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CATSPER1-201ENST00000312106 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 PDK3-202ENST00000441463 1921 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AP002409.1-201ENST00000584722 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ARL6-201ENST00000335979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 TPM3-202ENST00000302206 741 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 OR2T34-201ENST00000328782 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 OR2T3-201ENST00000359594 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ELOVL5-202ENST00000370913 580 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AL935212.2-201ENST00000419207 718 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AL354714.2-201ENST00000425270 1097 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC026785.1-201ENST00000505520 580 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AP005901.1-201ENST00000508721 1181 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC008013.1-201ENST00000612219 629 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC022730.4-201ENST00000520259 2367 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 JMJD7-PLA2G4B-201ENST00000342159 2966 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ARSK-201ENST00000380009 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LINC00969-212ENST00000445430 4208 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 PKD2L1-201ENST00000318222 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 HPD-201ENST00000289004 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SCNN1A-203ENST00000360168 3481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 NVL-201ENST00000281701 3123 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 KIR3DL2-202ENST00000326321 1877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 GBAP1-201ENST00000368374 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 USP3-202ENST00000380324 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ETFDH-201ENST00000307738 1903 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ZNF800-202ENST00000393312 2375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 PSG3-201ENST00000327495 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 IL1RAP-207ENST00000422485 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 TAF1A-203ENST00000366890 1648 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 POLE3-202ENST00000374171 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 ZNRD1ASP-219ENST00000448093 2296 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 AC004884.1-201ENST00000393647 319 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 GAPDHP2-201ENST00000432206 998 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO3Q8TAP4 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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