Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CASP7-210ENST00000614447 2555 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SCML1-204ENST00000398080 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 C9orf64-201ENST00000314700 2067 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 RPS3-217ENST00000531188 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 WFDC5-201ENST00000307971 1034 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 BANF1P4-201ENST00000420029 270 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC026785.1-201ENST00000505520 580 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC097658.2-201ENST00000512715 624 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 FGL1-206ENST00000518650 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC127537.3-201ENST00000566532 749 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 C17orf62-206ENST00000577436 1079 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SKAP1-AS1-201ENST00000582246 687 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CD300LF-210ENST00000583937 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MXRA7-206ENST00000589082 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 DNAJB14-212ENST00000610281 339 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SDE2-201ENST00000272091 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CIZ1-228ENST00000634901 3462 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 WASHC2A-201ENST00000282633 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 C2orf15-201ENST00000302513 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC009927.1-201ENST00000510501 1779 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 PTPN11-205ENST00000635625 1794 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CMTR2-202ENST00000434935 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SPATA33-201ENST00000301031 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ACO1-202ENST00000379923 3601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SERINC3-201ENST00000255175 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CDKL2-201ENST00000307465 2565 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 LGR6-201ENST00000255432 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 NDUFA5-212ENST00000618945 1432 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 RASGEF1A-203ENST00000395809 4104 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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PTPRJQ12913 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MYL5-201ENST00000400159 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MED20-204ENST00000409312 932 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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PTPRJQ12913 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AL132709.1-202ENST00000448840 588 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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PTPRJQ12913 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 GOLGA2-210ENST00000490628 428 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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PTPRJQ12913 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC009086.1-201ENST00000567219 309 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SARS2-211ENST00000598831 665 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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PTPRJQ12913 AC244226.1-201ENST00000631943 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CLDN10-203ENST00000376873 2656 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 NEFL-201ENST00000610854 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MCMDC2-202ENST00000396592 2373 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC004847.1-201ENST00000568457 1911 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AL662907.1-201ENST00000622988 1360 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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