Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 KIAA0907-207ENST00000478002 1065 ntTSL 56.6□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 COPG1-202ENST00000504350 672 ntTSL 36.6□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-205ENST00000505583 583 ntTSL 1 (best)6.47□□□□□ -1.372e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.372e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 THOC2-205ENST00000432353 3188 ntTSL 1 (best)6.45□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 EHBP1L1-207ENST00000531106 176 ntTSL 36.43□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-208ENST00000507009 388 ntTSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-215ENST00000513677 221 ntTSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 XRCC5-207ENST00000471649 610 ntTSL 26.32□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CSNK1E-214ENST00000498529 381 ntTSL 36.22□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MACF1-221ENST00000487656 323 ntTSL 36.16□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-214ENST00000559258 1047 ntTSL 26.03□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ZFPM2-209ENST00000522296 3312 ntTSL 25.98□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 THOC2-209ENST00000448128 1365 ntTSL 55.87□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-212ENST00000511198 444 ntTSL 1 (best)5.71□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TDG-206ENST00000540956 1014 ntTSL 25.49□□□□□ -1.532e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.532e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-207ENST00000558539 595 ntTSL 55.36□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TDG-207ENST00000542926 1277 ntTSL 55.16□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-219ENST00000559751 639 ntTSL 55.15□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-206ENST00000558522 1074 ntTSL 25.07□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-223ENST00000561171 933 ntTSL 25.07□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 IMPAD1-203ENST00000520392 584 ntTSL 24.98□□□□□ -1.612e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.612e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TMEM59-206ENST00000420738 728 ntTSL 34.96□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TMEM59-207ENST00000440019 618 ntTSL 24.96□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SEC22A-204ENST00000473494 1011 ntTSL 34.86□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SEC22A-206ENST00000480631 550 ntTSL 54.86□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TYW5-203ENST00000452512 2557 ntTSL 24.83□□□□□ -1.642e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 THOC2-203ENST00000416618 657 ntTSL 54.81□□□□□ -1.642e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 FAM13A-215ENST00000511145 743 ntTSL 34.74□□□□□ -1.652e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 RAN-206ENST00000535090 657 ntTSL 54.64□□□□□ -1.672e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 RAN-209ENST00000539498 1659 ntTSL 24.61□□□□□ -1.672e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 LBR-206ENST00000441022 536 ntTSL 24.55□□□□□ -1.682e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-216ENST00000559619 448 ntTSL 24.53□□□□□ -1.682e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TTC37-212ENST00000513823 577 ntTSL 44.51□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ELP2-206ENST00000535093 582 ntTSL 44.41□□□□□ -1.72e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-210ENST00000508841 610 ntTSL 54.3□□□□□ -1.722e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.742e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GULP1-212ENST00000467422 587 ntTSL 34.16□□□□□ -1.742e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 NADK2-204ENST00000404560 3317 ntTSL 1 (best)4.12□□□□□ -1.752e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 THOC2-208ENST00000441692 4364 ntTSL 54.11□□□□□ -1.752e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 RCOR3-209ENST00000528066 569 ntTSL 34.08□□□□□ -1.762e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TATDN3-204ENST00000497768 302 ntTSL 54.06□□□□□ -1.762e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 BAZ1A-205ENST00000553573 445 ntTSL 33.8□□□□□ -1.82e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 FNBP4-207ENST00000528388 814 ntTSL 23.6□□□□□ -1.832e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-214ENST00000513557 277 ntTSL 1 (best)3.51□□□□□ -1.852e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 RINT1-203ENST00000474123 811 ntTSL 23.44□□□□□ -1.862e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.862e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-211ENST00000510196 508 ntTSL 1 (best)3.19□□□□□ -1.92e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TMEM123-206ENST00000529492 549 ntTSL 23□□□□□ -1.932e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GULP1-213ENST00000476422 582 ntTSL 22.97□□□□□ -1.932e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 THOC2-213ENST00000464604 664 ntTSL 22.95□□□□□ -1.942e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.942e-7■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 BAZ1A-206ENST00000553853 433 ntTSL 32.93□□□□□ -1.942e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ETNK1-204ENST00000539974 441 ntTSL 22.92□□□□□ -1.942e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.951e-11■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 RBM28-207ENST00000488249 570 ntTSL 32.75□□□□□ -1.972e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CCNG1-212ENST00000512532 540 ntTSL 22.63□□□□□ -1.992e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TTC37-209ENST00000510228 511 ntTSL 32.61□□□□□ -1.992e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TMEM123-205ENST00000528969 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 42.6□□□□□ -1.992e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -22e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.012e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.012e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 JMY-202ENST00000412001 409 ntTSL 32.49□□□□□ -2.014e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PPP1R12A-216ENST00000550510 631 ntTSL 52.45□□□□□ -2.028e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-203ENST00000503255 486 ntTSL 1 (best)2.25□□□□□ -2.052e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.052e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PHKB-216ENST00000568439 499 ntTSL 32.05□□□□□ -2.082e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-207ENST00000506679 606 ntTSL 1 (best)1.83□□□□□ -2.122e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GYPB-209ENST00000508618 388 ntTSL 21.32□□□□□ -2.22e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TMEM123-203ENST00000525577 550 ntTSL 41.06□□□□□ -2.242e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 G2E3-209ENST00000550944 565 ntTSL 20.99□□□□□ -2.252e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TOP3B-203ENST00000424393 824 ntTSL 511.87□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 43
SF3B1O75533 AC087380.1-204ENST00000418729 1026 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 43
SF3B1O75533 AC087380.1-203ENST00000420726 752 ntTSL 56.39□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 43
SF3B1O75533 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 43
SF3B1O75533 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 43
SF3B1O75533 ESYT1-201ENST00000267113 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 43
SF3B1O75533 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 43
SF3B1O75533 ORC1-201ENST00000371566 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 43
SF3B1O75533 ORC1-202ENST00000371568 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 43
SF3B1O75533 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 43
SF3B1O75533 RPL8-214ENST00000534781 716 ntTSL 216.05■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 43
SF3B1O75533 AC016723.1-202ENST00000436982 643 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.815e-6■■■■■ 43
SF3B1O75533 KMT2C-208ENST00000473186 12854 ntTSL 1 (best)4.42□□□□□ -1.77e-6■■■■■ 43
SF3B1O75533 SCART1-202ENST00000463137 4756 ntTSL 219.74■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 43
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