Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQE9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQE9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQE9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQE9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQE9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQE9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQE9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQE9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQE9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQE9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQE9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQE9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQE9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQE9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQE9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQE9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQE9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQE9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQE9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQE9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQE9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQE9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQE9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQE9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQE9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQE9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQE9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQE9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQE9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQE9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQE9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQE9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQE9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms