Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.66■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms