Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms