Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
WASHC2CQ9Y4E1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
WASHC2CQ9Y4E1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
WASHC2CQ9Y4E1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms