Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms