Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9Y3F1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9Y3F1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms