Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7AQ9Y3A4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP7AQ9Y3A4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms