Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP11BQ9Y2G3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11BQ9Y2G3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11BQ9Y2G3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11BQ9Y2G3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11BQ9Y2G3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11BQ9Y2G3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11BQ9Y2G3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11BQ9Y2G3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11BQ9Y2G3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11BQ9Y2G3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11BQ9Y2G3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms