Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3IP3Q9Y228 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms