Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNQ9UQP3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms