Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN8AQ9UQD0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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