Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNRC6BQ9UPQ9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms