Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4E1Q9UPM8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms