Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF1Q9UMS5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF1Q9UMS5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms