Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYO6Q9UM54 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO6Q9UM54 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms