Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
INO80Q9ULG1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
INO80Q9ULG1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms