Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DSEQ9UL01 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DSEQ9UL01 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms