Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CROTQ9UKG9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms