Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDC23Q9UJX2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC23Q9UJX2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms