Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA3Q9UI47 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA3Q9UI47 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms