Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRDQ9UH36 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms