Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT3Q9UH03 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT3Q9UH03 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEPT3Q9UH03 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEPT3Q9UH03 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEPT3Q9UH03 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEPT3Q9UH03 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms