Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5BQ9UGL1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5BQ9UGL1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5BQ9UGL1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms