Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT8Q9UFF9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT8Q9UFF9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT8Q9UFF9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms