Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFDP1Q9UEE9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CFDP1Q9UEE9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms