Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms