Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPR1Q9UBH6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XPR1Q9UBH6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms