Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL20A1Q9P218 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL20A1Q9P218 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms