Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC45.06■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC45.06■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC45.05■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC45.01■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC45.01■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
CCDC180Q9P1Z9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC45■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC44.97■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC44.97■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC44.96■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC44.96■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC44.95■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC44.95■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC44.95■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.79
CCDC180Q9P1Z9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms