Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms