Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms