Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDE1Q9NZC3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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