Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VNN3Q9NY84 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VNN3Q9NY84 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms