Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA8Q9NY65 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TUBA8Q9NY65 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA8Q9NY65 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA8Q9NY65 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA8Q9NY65 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA8Q9NY65 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA8Q9NY65 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA8Q9NY65 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA8Q9NY65 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA8Q9NY65 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA8Q9NY65 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA8Q9NY65 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA8Q9NY65 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TUBA8Q9NY65 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBA8Q9NY65 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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