Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BARHL2Q9NY43 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms